Главная/Услуги/Онкология/Диагностика рака
Cancer Diagnostics · CeGaT

Молекулярная диагностика рака

В лечении рака нет универсального подхода, так как опухоли у каждого пациента уникальны. Поэтому важно максимально точно исследовать каждую опухоль. Комплексное геномное профилирование опухоли с использованием NGS помогает выявить клинически значимые мутации в более чем 700 генах, связанных с опухолями, а также терапевтически значимые fusion в 30 генах.

> 700 генов
опухолевые гены
> 96%
чувствительность
> 99.9%
специфичность
2–3 недели
отчёт
01 · Об исследовании

Подробно об исследовании

Это позволяет выбрать наиболее эффективное лечение для каждого пациента. Дополнительно мы проводим анализ на fusion транскриптов РНК в более чем 200 генах и определяем уровень мутационной нагрузки (TMB), микросателлитную нестабильность (MSI), вирусные инфекции (HPV, EBV) и статус дефицита гомологичной рекомбинации (HRD), что помогает прогнозировать ответ на терапию ингибиторами PARP и химиотерапию на основе платины.

Компания CeGaT с помощью NGS-технологии и многолетнего опыта в генетической диагностике выявляет соматические изменения, которые способствуют росту опухоли и лекарственной устойчивости, а также представляют терапевтические мишени.

Все полученные данные суммируются в подробный отчёт в течение 2–3 недель, что позволяет лечащему врачу подобрать эффективное лечение для каждого пациента на основе актуальных научных данных.

Гены опухолиБолее 700
RNA fusionБолее 30 (на ДНК) / > 200 (CancerFusionRx®)
Покрытие500 – 1000×
Чувствительность> 96%
Специфичность> 99.9%
TAT2–3 недели
02 · Наши решения

Что входит в диагностику

Результаты группируются по основным категориям и представляются в виде блоков.

Решение

Содержание

Опухолевые клетки

Биомаркеры

TMB · MSI · HRD

Драйверы

Соматические и герминальные

Терапия

EMA / FDA

Доля опухолевых клеток
Да
TMB · MSI
Да
HRD (PARP / платина)
Да
Вирусные инфекции (HPV / EBV)
Да
SNV / indel / fusion / CNV
Да
Герминальные варианты
Да
Фармакогенетика
Да
CHIP (клональный гемопоэз)
Да
Список одобренных препаратов
Да
Подбор клинических исследований
Да
03 · Оборудование

Illumina NovaSeq 6000 & NovaSeq X Plus

Исследования проводятся с использованием систем NovaSeq 6000 и NovaSeq X Plus — это быстрые и самые точные системы секвенирования коротких прочтений. Образцы секвенируются в режиме 2 × 100 bp или 2 × 150 bp, в зависимости от объекта и требований заказчика.

Если вам нужны параметры, отличные от стандартных — сообщите, мы можем предложить дополнительные варианты.

Подробнее о технологиях →
Throughput
до 16 Tb за прогон
Read length
2 × 100 / 2 × 150
Accuracy
Q30 ≥ 90%
Coverage
по задаче
04 · Результаты

Как вы получаете данные

В доставку включены демультиплексированные и триммированные файлы формата FASTQ. Дополнительные биоинформатические опции также доступны.

Удалённый носитель

Размещение данных на защищённом сервере. Защищённая ссылка для скачивания с подтверждением целостности по контрольным суммам.

Физический носитель

Доставка данных на жёстком диске — для больших проектов и случаев, когда внутренние политики клиента ограничивают онлайн-передачу.

06 · Требования к образцам

Перед отправкой

Нормальная ткань: 1–2 мл крови с ЭДТА (рекомендуемый тип образца) или геномная ДНК (1–2 мкг). Опухолевая ткань: содержание опухолевых клеток не менее 20%, FFPE-блок опухоли (мин. 5×5×5 мм) или срезы FFPE (мин. 10 срезов 4–10 мкм) или геномная ДНК (> 200 нг) или свежезамороженная ткань, либо 3 × 10 мл пробирки с бесклеточной ДНК для жидкостной биопсии.

Подробнее о требованиях

Закажите исследование

Оставьте свои контактные данные и наши менеджеры свяжутся с вами в ближайшее время!

  • Подбор платформы и дизайна эксперимента
  • Логистика образцов и пробоподготовка
  • Биоинформатический анализ и отчёт