Полное секвенирование экзома может использоваться для различных целей:
- популяционная генетика
- генетические заболевания
- редкие заболевания
- исследование опухолей
WES Basic
WES Classic
WES Premium
WES Flex
Виды
Человек
Виды
Человек
Виды
Человек
Виды
Человек, мышь/крыса
Качество ДНК
Высокомолекулярная ДНК
Качество ДНК
Высокомолекулярная ДНК
Качество ДНК
Различное качество ДНК
(н-р, фрагментированная)
Качество ДНК
В зависимости от протокола
Целевое обогащение
Целевое обогащение
Целевое обогащение
Целевое обогащение
Целевая область
Экзом и мтДНК (Twist), 37 Mb
Целевая область
Экзом и мтДНК (Twist), 37 Mb
Целевая область
Экзом и мтДНК (Twist), 37 Mb
Целевая область
Экзом (Twist), 33 Mb;
Экзом и мтДНК (Twist), 37 Mb
Платформа секвенирования
Illumina
Платформа секвенирования
Illumina
Платформа секвенирования
Illumina
Платформа секвенирования
Illumina
Объем данных секвенирования
6 Гб
~50х покрытие (зависит от качества исходного материала)
Объем данных секвенирования
12 Гб
~100х покрытие (зависит от качества исходного материала)
Объем данных секвенирования
12 Гб
~100х (зависит от качества исходного материала)
Объем данных секвенирования
В соответсвии с требованиями заказчика
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
30 820 рублей
39 500 рублей
47 700 рублей
Рассчитывается в соответствии с требованиями
WES Basic
Виды
Человек
Качество ДНК
Высокомолекулярная ДНК
Целевое обогащение
Целевая область
Экзом и мтДНК (Twist), 37 Mb
Платформа секвенирования
Illumina
Объем данных секвенирования
6 Гб
~50х покрытие
(зависит от качества исходного материала)
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
30 820 рублей
WES Classic
Виды
Человек
Качество ДНК
Высокомолекулярная ДНК
Целевое обогащение
Целевая область
Экзом и мтДНК (Twist), 37 Mb
Платформа секвенирования
Illumina
Объем данных секвенирования
12 Гб
~100х покрытие
(зависит от качества исходного материала)
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
WES Premium
Виды
Человек
Качество ДНК
Различное качество ДНК
(н-р, фрагментированная)
Целевое обогащение
Целевая область
Экзом и мтДНК (Twist), 37 Mb
Платформа секвенирования
Illumina
Объем данных секвенирования
12 Гб
~100-кратное покрытие
(зависит от качества исходного материала)
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
47 700 рублей
WES Flex
Виды
Человек, мышь/крыса
Качество ДНК
В зависимости от протокола
Целевое обогащение
Целевая область
Экзом (Twist), 33 Mb;
Экзом и мтДНК (Twist), 37 Mb
Платформа секвенирования
Illumina
Объем данных секвенирования
В соответсвии с требованиями заказчика
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
Рассчитывается в соответствии с требованиями
Образцы WGS секвенируются в режиме 2 x 100 bp или 2 x 150 bp, в зависимости от объекта и требований заказчика.
Если вам необходимы параметры секвенирования, отличающиеся от тех, что представлены выше, сообщите, пожалуйста! Мы можем предложить дополнительные варианты решений.
и триммированные файлы формата FASTQ. Дополнительные биоинформатические опции также доступны
Все более высокие уровни обработки включают данные с более низких уровней. Независимо от уровня анализа, в дополнение к данным, создается технический отчет.
Все данные Whole Exome Sequencing (WES) анализируются с использованием платформы Illumina DRAGEN Bio-IT. Мы можем проводить исследования WES (кроме WES Flex) на основе референсных геномах человека hg19 или GRCh38.
- Демультиплексирование и обрезка адаптеров (формат FASTQ)
- Анализ качества данных и метрик (формат CSV)
- MultiQC отчёт (формат HTML)
Уровень 2:
- Картирование (формат BAM)
- Анализ качества данных и метрик (формат CSV)
Уровень 3:
- Выявление однонуклеотидного полиморфизма и небольших вставок и делеций (инделов) (формат VCF)
- Анализ качества данных и метрик (формат CSV)
Уровень 4:
- Аннотация однонуклеотидных вариантов и делеций (форматы JSON и TSV) (только человеческие образцы)
Уровень 5 (один из следующих):
- Вызов вариаций числа копий (CNV) (формат VCF и GFF3) включая метрики (формат CSV) (только для человеческих образцов)
- Сравнение вариантов в нескольких образцах, например, ТРИО (формат VCF и TSV)
На нашем сайте вы найдете подробную информацию о необходимых объемах и качестве образцов, а также хранению и транспортировке.
Мы понимаем, что подготовка образцов может вызывать вопросы, поэтому наша команда готова оказать вам поддержку и консультации на каждом этапе процесса. Не стесняйтесь обращаться к нам – ваше удобство и успешное проведение исследования для нас приоритетны.