HLA-типирование с высоким разрешением

HLA-типирование

Система человеческого лейкоцитарного антигена (HLA) представляет собой группу генов, которые играют важную роль в иммунной системе человека. Область HLA высокополиморфна и содержит шесть классических генов HLA: класс I с HLA–A, –B и –C, и класс II с HLA-DRB1, –DQB1 и –DPB1. Кроме того, известно, что область HLA связана с более чем 100 мультифакториальными, сложными заболеваниями, в основном с воспалительной и аутоиммунной патогенезом. Для более глубокого понимания функций и сложных взаимодействий системы HLA, типирование HLA на основе секвенирования нового поколения (NGS) может быть очень полезным.

Области применения типирования HLA разнообразны:

• поддержка характеристики индивидуальной реакции на лекарственную терапию, включая фармакогенетику,
• предоставление важной информации для иммунотерапии в борьбе с раком,
• сопоставление HLA областей донора и реципиента для трансплантации.

Новейшее качественное оборудование

HLA-типирование

В зависимости от качества исходного материала мы предлагаем различные услуги для HLA-типирования. Каждый из наших продуктов может быть дополнен дополнительными услугами. Мы будем рады проконсультировать вас.

Техническая информация

Результаты типирования HLA генерируются на основе данных секвенирования полного экзома (WES, (2 x 100 п.н.)) с использованием специального биоинформатического алгоритма. Будут проанализированы следующие локусы:

• HLA класс I (HLA-A, -B и -C)
• HLA класс II (HLA-DRB1, -DQB1 и -DPB1)

Вы получите результаты типирования HLA в формате TSV, вместе с ранее созданными данными экзома, включая демультиплексированные и обрезанные адаптеры файлы FASTQ.
Кроме типирования HLA, мы можем предложить дополнительные биоинформатические анализы данных экзома. Ознакомьтесь с нашими биоинформатическими опциями для дополнительного анализа данных WES.

Оборудование

Исследования проводятся с использованием системы NovaSeq 6000 и NovaSeq X Plus — это быстрые и самые точные системы секвенирования коротких прочтений.

Образцы WGS секвенируются в режиме 2 x 100 bp или 2 x 150 bp, в зависимости от объекта и требований заказчика.

Если вам необходимы параметры секвенирования, отличающиеся от тех, что представлены выше, сообщите, пожалуйста! Мы можем предложить дополнительные варианты решений.

Результаты исследования

В доставку включены демультиплексированные
и триммированные файлы формата FASTQ. Дополнительные биоинформатические опции также доступны

Размещение данных 
на защищенном сервере

Удаленный носитель

Доставка данных 
на жестком диске

Физический носитель

Требования к образцам

Перед отправкой образцов на секвенирование, крайне рекомендуем внимательно ознакомиться с требованиями к образцам, чтобы обеспечить наилучшие результаты.

На нашем сайте вы найдете подробную информацию о необходимых объемах и качестве образцов, а также хранению и транспортировке.

Мы понимаем, что подготовка образцов может вызывать вопросы, поэтому наша команда готова оказать вам поддержку и консультации на каждом этапе процесса. Не стесняйтесь обращаться к нам – ваше удобство и успешное проведение исследования для нас приоритетны.

Закажите исследование

Оставьте свои контактные данные и наши менеджеры свяжутся с Вами в ближайшее время!