Главная/Услуги/Иммуногенетика/Репертуар TCR
TCR-seq · immune repertoire

Секвенирование Т-клеточных рецепторов

Разгадывая иммунный код. Индивидуальный репертуар TCR формируется путём V/J/D-рекомбинации, которая приводит к чрезвычайно разнообразному региону, определяющему комплементарность 3 (CDR3). Этот регион является привлекательной целью для оценки общего разнообразия репертуара TCR.

48 600 ₽
за образец
CDR3 β-цепь
целевой регион
2 млн кластеров
глубина
PBMC / FFPE
разные материалы
01 · Об исследовании

Что даёт исследование репертуара TCR

Исследование репертуара TCR может:

предоставить информацию о функциях Т-клеток в иммунном ответе, например, в иммуносупрессии;

позволить мониторинг лекарственной терапии, такой как иммунотерапия при раке, и связанных с этим изменений в состоянии Т-клеток;

улучшить персонализированную медицину путём анализа опухоль-инфильтрирующих Т-клеток.

ПлатформаIllumina
ЦельРНК
МишеньBeta (CDR3)
Объём данных2 млн кластеров
ВидыЧеловек
БиоинформатикаРеконструкция клонов + клональность
02 · Наши решения

TCR RNA

Решение

CeGaT

TCR RNA

Виды
Человек
Тип образца
Отсортированные клетки, PBMC, цельная кровь, свежезамороженная ткань, FFPE
Цель
РНК
Мишень
Beta (CDR3)
Платформа
Illumina
Объём данных
2 млн кластеров
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
Стоимость
48 600 ₽
03 · Оборудование

Illumina NovaSeq 6000 & NovaSeq X Plus

Исследования проводятся с использованием систем NovaSeq 6000 и NovaSeq X Plus — это быстрые и самые точные системы секвенирования коротких прочтений. Образцы секвенируются в режиме 2 × 100 bp или 2 × 150 bp, в зависимости от объекта и требований заказчика.

Если вам нужны параметры, отличные от стандартных — сообщите, мы можем предложить дополнительные варианты.

Подробнее о технологиях →
Throughput
до 16 Tb за прогон
Read length
2 × 100 / 2 × 150
Accuracy
Q30 ≥ 90%
Coverage
по задаче
04 · Результаты

Как вы получаете данные

В доставку включены демультиплексированные и триммированные файлы формата FASTQ. Дополнительные биоинформатические опции также доступны.

Удалённый носитель

Размещение данных на защищённом сервере. Защищённая ссылка для скачивания с подтверждением целостности по контрольным суммам.

Физический носитель

Доставка данных на жёстком диске — для больших проектов и случаев, когда внутренние политики клиента ограничивают онлайн-передачу.

05 · Биоинформатика

Уровни биоинформатического анализа

Сырые данные секвенирования обрабатываются автоматически. По умолчанию используется Уровень 1; более высокий уровень — опция.

Уровень 01 · включён

Демультиплексирование

Демультиплексирование и обрезка адаптеров (FASTQ).

Уровень 02

Реконструкция клонов

Реконструкция клонов TCR. Оценка клональности и разнообразия (TSV, PNG).

По запросу

Дополнительные опции

Отслеживание клонов TCR во времени. Изменения репертуара на разных временных точках.

06 · Требования к образцам

Перед отправкой

Перед отправкой образцов на секвенирование настоятельно рекомендуем ознакомиться с требованиями — это обеспечит наилучшие результаты. Наша команда готова оказать поддержку и консультации на каждом этапе подготовки.

Подробнее о требованиях

Закажите исследование

Оставьте свои контактные данные и наши менеджеры свяжутся с вами в ближайшее время!

  • Подбор платформы и дизайна эксперимента
  • Логистика образцов и пробоподготовка
  • Биоинформатический анализ и отчёт