Разгадывая иммунный код. Индивидуальный репертуар TCR формируется путём V/J/D-рекомбинации, которая приводит к чрезвычайно разнообразному региону, определяющему комплементарность 3 (CDR3). Этот регион является привлекательной целью для оценки общего разнообразия репертуара TCR.
Исследование репертуара TCR может:
предоставить информацию о функциях Т-клеток в иммунном ответе, например, в иммуносупрессии;
позволить мониторинг лекарственной терапии, такой как иммунотерапия при раке, и связанных с этим изменений в состоянии Т-клеток;
улучшить персонализированную медицину путём анализа опухоль-инфильтрирующих Т-клеток.
Исследования проводятся с использованием систем NovaSeq 6000 и NovaSeq X Plus — это быстрые и самые точные системы секвенирования коротких прочтений. Образцы секвенируются в режиме 2 × 100 bp или 2 × 150 bp, в зависимости от объекта и требований заказчика.
Если вам нужны параметры, отличные от стандартных — сообщите, мы можем предложить дополнительные варианты.
Подробнее о технологиях →В доставку включены демультиплексированные и триммированные файлы формата FASTQ. Дополнительные биоинформатические опции также доступны.
Размещение данных на защищённом сервере. Защищённая ссылка для скачивания с подтверждением целостности по контрольным суммам.
Доставка данных на жёстком диске — для больших проектов и случаев, когда внутренние политики клиента ограничивают онлайн-передачу.
Сырые данные секвенирования обрабатываются автоматически. По умолчанию используется Уровень 1; более высокий уровень — опция.
Демультиплексирование и обрезка адаптеров (FASTQ).
Реконструкция клонов TCR. Оценка клональности и разнообразия (TSV, PNG).
Отслеживание клонов TCR во времени. Изменения репертуара на разных временных точках.
Перед отправкой образцов на секвенирование настоятельно рекомендуем ознакомиться с требованиями — это обеспечит наилучшие результаты. Наша команда готова оказать поддержку и консультации на каждом этапе подготовки.
Оставьте свои контактные данные и наши менеджеры свяжутся с вами в ближайшее время!