17 500 ₽
Classic
Раскрытие микробного мира. Shotgun-метагеномное секвенирование анализирует полный ДНК-репертуар образца и позволяет точно обнаруживать микробы (бактерии, археи, грибы, простейшие, вирусы и т. д.) до уровня вида. Соответственно, можно анализировать функциональные гены, кодирующие специфические метаболические ферменты.
Метагеномное секвенирование является лучшим выбором, когда необходимо тщательно охарактеризовать микробиомы, включая точную идентификацию микробных видов и их функциональный репертуар.
В отличие от 16S/ITS, shotgun секвенирует всю ДНК в образце — бактерии, археи, грибы, простейшие, вирусы и фаги. Это даёт штаммовое разрешение и доступ к функциональному профилю микробиома.
Исследования проводятся с использованием систем NovaSeq 6000 и NovaSeq X Plus — это быстрые и самые точные системы секвенирования коротких прочтений. Образцы секвенируются в режиме 2 × 100 bp или 2 × 150 bp, в зависимости от объекта и требований заказчика.
Если вам нужны параметры, отличные от стандартных — сообщите, мы можем предложить дополнительные варианты.
Подробнее о технологиях →В доставку включены демультиплексированные и триммированные файлы формата FASTQ. Дополнительные биоинформатические опции также доступны.
Размещение данных на защищённом сервере. Защищённая ссылка для скачивания с подтверждением целостности по контрольным суммам.
Доставка данных на жёстком диске — для больших проектов и случаев, когда внутренние политики клиента ограничивают онлайн-передачу.
Сырые данные обрабатываются автоматически. По умолчанию используется Уровень 1; более высокие уровни — опция.
Демультиплексирование и обрезка адаптеров (FASTQ).
Картирование данных на базу микробиома (DAA).
Таксономическая и функциональная классификация через MEGAN 6 (MEGAN-формат). Таблицы изобилия по уровню вида (XLSX, BIOM).
Перед отправкой образцов на секвенирование настоятельно рекомендуем ознакомиться с требованиями — это обеспечит наилучшие результаты. Наша команда готова оказать поддержку и консультации на каждом этапе подготовки.
Оставьте свои контактные данные и наши менеджеры свяжутся с вами в ближайшее время!