Метагеномное секвенирование является лучшим выбором, когда необходимо тщательно охарактеризовать микробиомы, включая точную идентификацию микробных видов и их функциональный репертуар.
Shotgun Metagenomics Classic
Shotgun Metagenomics Flex
Виды
Бактерии, археи, грибы, протозои, (вирусы)
Виды
Бактерии, археи, грибы, протозои, (вирусы)
Тип образца
Метагеномная ДНК
Тип образца
Метагеномная ДНК
Цель
Геномы множества прокариотических и эукариотических организмов
Цель
Геномы множества прокариотических и эукариотических организмов
ПЦР-амплификация
Да
ПЦР-амплификация
В зависимости от выбранного протокола
Длина чтения
2 x 150 bp или 2 x 100 bp
Длина чтения
2 x 150 bp или 2 x 100 bp
Платформа секвенирования
Illumina
Платформа секвенирования
Illumina
Объем данных секвенирования
2 Гб (10М кластеров)
Объем данных секвенирования
В соответсвии с требованиями заказчика
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
15 550 рублей
Рассчитывается в соответствии с требованиями
Shotgun Metagenomics Classic
Виды
Бактерии, археи, грибы, протозои, (вирусы)
Тип образца
Метагеномная ДНК
Цель
Геномы множества прокариотических и эукариотических организмов
ПЦР-амплификация
Да
Длина чтения
2 x 150 bp или 2 x 100 bp
Платформа секвенирования
Illumina
Объем данных секвенирования
2 Гб (10М кластеров)
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
15 550 рублей
Shotgun Metagenomics Flex
Виды
Бактерии, археи, грибы, протозои, (вирусы)
Тип образца
Метагеномная ДНК
Цель
Геномы множества прокариотических и эукариотических организмов
ПЦР-амплификация
В зависимости от выбранного протокола
Длина чтения
2 x 150 bp или 2 x 100 bp
Платформа секвенирования
Illumina
Объем данных секвенирования
В соответсвии с требованиями заказчика
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
Рассчитывается в соответствии с требованиями
Образцы WGS секвенируются в режиме 2 x 100 bp или 2 x 150 bp, в зависимости от объекта и требований заказчика.
Если вам необходимы параметры секвенирования, отличающиеся от тех, что представлены выше, сообщите, пожалуйста! Мы можем предложить дополнительные варианты решений.
и триммированные файлы формата FASTQ. Дополнительные биоинформатические опции также доступны
Уровень 1:
- Демультиплексирование и обрезка адаптеров данных секвенирования (формат FASTQ)
Уровень 2:
- Картирование данных секвенирования на базе микробиома (формат DAA*)
Уровень 3:
- Таксономическая и функциональная классификация с использованием MEGAN 6 (формат MEGAN*)
- Создание таблиц таксономического изобилия, включая количество последовательностей и относительное изобилие до уровня вида (форматы XLSX и BIOM)
- Создание таблиц микробных функций, включая количество последовательностей и относительное изобилие функциональных генов, классифицированных с использованием базы данных KEGG (формат XLSX)
- Создание столбчатых диаграмм, показывающих относительное изобилие до уровня вида (формат PNG)
*Эти файлы можно интерактивно исследовать и дополнительно анализировать с помощью MEGAN6, удобного и открытого программного обеспечения для анализа данных микробиома
На нашем сайте вы найдете подробную информацию о необходимых объемах и качестве образцов, а также хранению и транспортировке.
Мы понимаем, что подготовка образцов может вызывать вопросы, поэтому наша команда готова оказать вам поддержку и консультации на каждом этапе процесса. Не стесняйтесь обращаться к нам – ваше удобство и успешное проведение исследования для нас приоритетны.