Главная/Услуги/Иммуногенетика/Иммунопрофилирование клеток
SIP · single-cell immune profiling

Иммунопрофилирование отдельных клеток

Открывая секреты иммунитета. Мы предлагаем профилирование иммунных клеток на уровне отдельных клеток (SIP) с использованием системы Chromium™ от 10x Genomics® и новейшей технологии NGS. Иммуноспецифические участки α- и β-цепей (TCR) и Ig-цепей (BCR) предоставляются в виде парных последовательностей.

SIP B / T / Combined
три формата
TCR α/β + BCR
парные цепи
10x Chromium
+ Illumina
Человек, мышь
оба вида
01 · Об исследовании

Парные V(D)J + транскриптом

Парные цепи Т- и B-клеточных рецепторов вместе с экспрессией генов на одной клетке — это функциональная аннотация клонотипов: можно понять, к какому функциональному состоянию принадлежит каждый клон.

Хотите, чтобы на ваших данных были проведены дополнительные биоинформатические анализы, помимо включённых в поставку? Каждый из наших продуктов может быть дополнен дополнительными услугами. Мы будем рады проконсультировать вас.

Платформа10x Chromium™ + Illumina
ВидыЧеловек, мышь
Тип образцаЗамороженные клеточные суспензии
Жизнеспособность≥ 90%
Количество клеток1 млн в 1 мл среды для криоконсервации
ЦелиGEX + TCR / BCR / TCR+BCR
02 · Наши решения

Три варианта SIP

Решение

10x · CeGaT

SIP B-Cell

10x · CeGaT

SIP T-Cell

10x · CeGaT

SIP Combined

Виды
Человек, мышь
Человек, мышь
Человек, мышь
Тип образца
Замороженные клеточные суспензии
Замороженные клеточные суспензии
Замороженные клеточные суспензии
Требования
1 млн клеток в 1 мл среды для криоконсервации, ≥ 90% жизнеспособность
1 млн клеток в 1 мл среды для криоконсервации, ≥ 90% жизнеспособность
1 млн клеток в 1 мл среды для криоконсервации, ≥ 90% жизнеспособность
Цель
Экспрессия генов + BCR
Экспрессия генов + TCR
Экспрессия генов + BCR + TCR
Платформа
Chromium™ (10x Genomics®) + Illumina
Chromium™ (10x Genomics®) + Illumina
Chromium™ (10x Genomics®) + Illumina
Объём данных
По требованию
По требованию
По требованию
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
Отчёт и файлы FASTQ
Отчёт и файлы FASTQ
Стоимость
По запросу
По запросу
По запросу
03 · Оборудование

Illumina NovaSeq 6000 & NovaSeq X Plus

Исследования проводятся с использованием систем NovaSeq 6000 и NovaSeq X Plus — это быстрые и самые точные системы секвенирования коротких прочтений. Образцы секвенируются в режиме 2 × 100 bp или 2 × 150 bp, в зависимости от объекта и требований заказчика.

Если вам нужны параметры, отличные от стандартных — сообщите, мы можем предложить дополнительные варианты.

Подробнее о технологиях →
Throughput
до 16 Tb за прогон
Read length
2 × 100 / 2 × 150
Accuracy
Q30 ≥ 90%
Coverage
по задаче
04 · Результаты

Как вы получаете данные

В доставку включены демультиплексированные и триммированные файлы формата FASTQ. Дополнительные биоинформатические опции также доступны.

Удалённый носитель

Размещение данных на защищённом сервере. Защищённая ссылка для скачивания с подтверждением целостности по контрольным суммам.

Физический носитель

Доставка данных на жёстком диске — для больших проектов и случаев, когда внутренние политики клиента ограничивают онлайн-передачу.

06 · Требования к образцам

Перед отправкой

Перед отправкой образцов на секвенирование настоятельно рекомендуем ознакомиться с требованиями — это обеспечит наилучшие результаты. Наша команда готова оказать поддержку и консультации на каждом этапе подготовки.

Подробнее о требованиях

Закажите исследование

Оставьте свои контактные данные и наши менеджеры свяжутся с вами в ближайшее время!

  • Подбор платформы и дизайна эксперимента
  • Логистика образцов и пробоподготовка
  • Биоинформатический анализ и отчёт