Секвенирование малых РНК

Главная

/

Услуги

/

Секвенирование

/

Секвенирование малых РНК

Заказать исследование

Об исследовании

Наши решения

Опции по биоинформатике

Требования к образцам

Секвенирование малых РНК

Секвенирование малых РНК фокусируется на коротких молекулах РНК. Эти короткие молекулы РНК играют важную роль в процессе сайленсинга и посттранскрипционной регуляции экспрессии генов. Секвенирование малых РНК позволяет более детально анализировать эти молекулы и, следовательно, позволяет:

- профилировать все малые РНК и miRNA в транскриптоме,
- идентифицировать новые малые РНК,
- проводить тканеспецифический дифференциальный анализ экспрессии малых РНК,
- выявлять новые биомаркеры.

Новейшее качественное оборудование

Изучите наш портфель продуктов для секвенирования генома

Мы предоставляем комплексную и первоклассную поддержку проекта – от выбора подходящего продукта до оценки данных. Каждый проект курируется и на протяжении всего проекта у вас будет контактное лицо для обсуждения любых деталей.

Виды

Человек

Виды

Млекопитающие

другие виды по запросу

Качество РНК

RIN ≥ 8

Качество РНК

Различное/низкое качество

Платформа секвенирования

Illumina

Платформа секвенирования

Illumina

Объем данных секвенирования

≥ 10M кластеров на образец.

Объем данных секвенирования

В соответсвии с требованиями заказчика

Результаты

Отчёт и файлы FASTQ

Результаты

Отчёт и файлы FASTQ

Рассчитывается в соответствии с требованиями

Виды

Человек

Качество РНК

RIN ≥ 8

Платформа секвенирования

Illumina

Объем данных секвенирования

≥ 10M кластеров на образец.

Результаты

Отчёт и файлы FASTQ

Рассчитывается в соответствии с требованиями

Виды

Млекопитающие

другие виды по запросу

Качество РНК

Различное/низкое качество

Платформа секвенирования

Illumina

Объем данных секвенирования

В соответсвии с требованиями заказчика

Результаты

Отчёт и файлы FASTQ

Рассчитывается в соответствии с требованиями

Оборудование

Исследования проводятся с использованием системы NovaSeq 6000 и NovaSeq X Plus — это быстрые и самые точные системы секвенирования коротких прочтений.

Образцы WGS секвенируются в режиме 2 x 100 bp или 2 x 150 bp, в зависимости от объекта и требований заказчика.

Если вам необходимы параметры секвенирования, отличающиеся от тех, что представлены выше, сообщите, пожалуйста! Мы можем предложить дополнительные варианты решений.

Подробнее о технологиях

Результаты исследования

В доставку включены демультиплексированные
и триммированные файлы формата FASTQ. Дополнительные биоинформатические опции также доступны

Размещение данных  на защищенном сервере

Удаленный носитель

Доставка данных  на жестком диске

Физический носитель

Биоинформатика

Исходные данные секвенирования обрабатываются автоматически. Мы предлагаем различные уровни биоинформатического анализа. По умолчанию используется уровень 1. Чем выше уровень — тем больше данных можно получить. Высокие уровни включают в себя информацию, в том числе, с низких уровней. Независимо от выбранного уровня, вы получите отчет.

Уровень 1:

Демультиплексирование секвенированных данных (формат FASTQ).

Уровень 2:

Аннотация с использованием miRBase (формат TSV).
Квантификация miRNA (формат TSV).
Экспериментальное сравнение (формат HTML).
Прогнозирование новых микроРНК (форматы TSV и PDF).

Уровень 3:

Нормализация (формат TSV).
Анализ дифференциальной экспрессии генов (прочтения могут быть отнесены к известным микроРНК и pre-miRNA) (формат TSV).
Визуализация (формат PDF).

⚠ Для анализа дифференциальной экспрессии генов (сравнение групп) требуется минимум три повторных измерения в каждой группе.

Требования к образцам

Перед отправкой образцов на секвенирование, крайне рекомендуем внимательно ознакомиться с требованиями к образцам, чтобы обеспечить наилучшие результаты.

На нашем сайте вы найдете подробную информацию о необходимых объемах и качестве образцов, а также хранению и транспортировке.

Мы понимаем, что подготовка образцов может вызывать вопросы, поэтому наша команда готова оказать вам поддержку и консультации на каждом этапе процесса. Не стесняйтесь обращаться к нам – ваше удобство и успешное проведение исследования для нас приоритетны.

Подробнее о требованиях

Закажите исследование

Оставьте свои контактные данные и наши менеджеры свяжутся с Вами в ближайшее время!