Главная/Услуги/Онкология/Комплексное профилирование опухолей
CTP · comprehensive tumor profiling

Комплексное профилирование опухолей

Меняющаяся парадигма — отход от универсального подхода в сторону прецизионной медицины — подчёркивает важность комплексного профилирования опухолевых образцов. Комплексное профилирование предполагает одновременную оценку нескольких биомаркеров в одном анализе, включая TMB и MSI.

TMB · MSI
ключевые биомаркеры
WES + Panel + RNA
три подхода
от 100 650 ₽
за образец
760 / 160 / 20k
размер панелей
01 · Об исследовании

Интегративный подход к молекулярному анализу опухолей

Комплексное профилирование опухолей предполагает одновременную оценку нескольких биомаркеров в одном анализе. Этот подход не только позволяет выявить наиболее релевантные предсказательные маркеры для текущих таргетных терапий, но и ключевые иммунно-онкологические биомаркеры, такие как опухолевая мутационная нагрузка (TMB) и микросателлитная нестабильность (MSI).

TMB — биомаркер, измеряющий количество соматических мутаций в опухоли (mut/Mb). MSI вызывается нарушением системы репарации ДНК.

Применения: стратификация пациентов для выбора наилучшего лечения, выявление пациентов, подходящих для клинических испытаний, продвижение клинических исследований, особенно в области иммунотерапии.

ПлатформаIllumina
WES (CTP Somatic/Tumor)~ 20 000 генов
CTP TUM Panel~ 760 генов + 31 fusion
CTP PAT Panel160 генов
CTP FUS (RNA)RNA fusion panel
БиоинформатикаDRAGEN Bio-IT
02 · Наши решения

Пять решений CTP

CTP Somatic и CTP Tumor основаны на экзомном секвенировании (WES). CTP TUM, CTP PAT и CTP FUS — целевые панели CeGaT.

Решение

CeGaT · WES

CTP Somatic

CeGaT · WES

CTP Tumor

CeGaT · Panel

CTP TUM

CeGaT · Panel

CTP PAT

CeGaT · RNA

CTP FUS

Виды
Человек
Человек
Человек
Человек
Человек
Панель
WES (Twist Bioscience)
WES (Twist Bioscience)
Somatic tumor panel (CeGaT)
Molecular pathology panel (CeGaT)
RNA fusion panel (CeGaT)
Кол-во генов
~ 20 000
~ 20 000
~ 760
160
Tumor / Normal
Да
Нет
Нет
Нет
Стартовый материал
Свежезамороженная ткань, FFPE, ВМ ДНК или фрагментированная
Свежезамороженная ткань, FFPE, ВМ ДНК или фрагментированная
Свежезамороженная ткань, FFPE, ВМ ДНК или фрагментированная
Свежезамороженная ткань, FFPE, ВМ ДНК или фрагментированная
Тотальная РНК
Платформа
Illumina
Illumina
Illumina
Illumina
Illumina
Объём данных
12 Гб (норма) + 18 Гб (опухоль)
12 или 24 Гб (от клеточности)
10 Гб
По задаче
По задаче
Стоимость
143 900 ₽
По запросу
100 650 ₽
106 500 ₽
По запросу
03 · Оборудование

Illumina NovaSeq 6000 & NovaSeq X Plus

Исследования проводятся с использованием систем NovaSeq 6000 и NovaSeq X Plus — это быстрые и самые точные системы секвенирования коротких прочтений. Образцы секвенируются в режиме 2 × 100 bp или 2 × 150 bp, в зависимости от объекта и требований заказчика.

Если вам нужны параметры, отличные от стандартных — сообщите, мы можем предложить дополнительные варианты.

Подробнее о технологиях →
Throughput
до 16 Tb за прогон
Read length
2 × 100 / 2 × 150
Accuracy
Q30 ≥ 90%
Coverage
по задаче
04 · Результаты

Как вы получаете данные

В доставку включены демультиплексированные и триммированные файлы формата FASTQ. Дополнительные биоинформатические опции также доступны.

Удалённый носитель

Размещение данных на защищённом сервере. Защищённая ссылка для скачивания с подтверждением целостности по контрольным суммам.

Физический носитель

Доставка данных на жёстком диске — для больших проектов и случаев, когда внутренние политики клиента ограничивают онлайн-передачу.

06 · Требования к образцам

Перед отправкой

Перед отправкой образцов на секвенирование настоятельно рекомендуем ознакомиться с требованиями — это обеспечит наилучшие результаты. Наша команда готова оказать поддержку и консультации на каждом этапе подготовки.

Подробнее о требованиях

Закажите исследование

Оставьте свои контактные данные и наши менеджеры свяжутся с вами в ближайшее время!

  • Подбор платформы и дизайна эксперимента
  • Логистика образцов и пробоподготовка
  • Биоинформатический анализ и отчёт