500 – 10 000
клеток на пробу
Человеческое тело состоит более чем из 30 триллионов клеток. В пределах органа или ткани встречаются различные типы и популяции клеток, которые значительно различаются по своему транскрипционному профилю. Технологии секвенирования РНК отдельных клеток позволяют анализировать индивидуальные транскриптомы тысяч клеток в одной пробе.
Традиционные методы секвенирования РНК (bulk RNA-seq) не могут выявить гетерогенность образцов различных клеточных популяций. Технологии секвенирования РНК отдельных клеток позволяют анализировать индивидуальные транскриптомы тысяч клеток в одной пробе и выявлять транскрипционные изменения на уровне специфических типов клеток, что может привести к идентификации новых биомаркеров или помочь лучше понять биологию тканей или заболеваний.
Области применения секвенирования РНК отдельных клеток: выявление гетерогенности опухолей, дифференцировка клеток и отслеживание их происхождения, реакция на терапевтические вмешательства, исследование биомаркеров.
Исследования проводятся с использованием систем NovaSeq 6000 и NovaSeq X Plus — это быстрые и самые точные системы секвенирования коротких прочтений. Образцы секвенируются в режиме 2 × 100 bp или 2 × 150 bp, в зависимости от объекта и требований заказчика.
Если вам нужны параметры, отличные от стандартных — сообщите, мы можем предложить дополнительные варианты.
Подробнее о технологиях →В доставку включены демультиплексированные и триммированные файлы формата FASTQ. Дополнительные биоинформатические опции также доступны.
Размещение данных на защищённом сервере. Защищённая ссылка для скачивания с подтверждением целостности по контрольным суммам.
Доставка данных на жёстком диске — для больших проектов и случаев, когда внутренние политики клиента ограничивают онлайн-передачу.
Мы анализируем данные scRNA-seq с помощью программного обеспечения Cell Ranger от 10x Genomics®. Этот рабочий процесс включает выравнивание, создание матриц признаков, кластеризацию клеток и анализ экспрессии генов.
Демультиплексирование секвенированных данных, включая индексные прочтения (FASTQ).
Выравнивание (BAM). Loupe (CLOUPE) для визуализации. Таблицы счёта выравненных прочтений (TSV). Предварительная кластеризация (CSV). Предварительный анализ дифференциальной экспрессии (CSV).
Для более чем одного образца данные одиночных клеток объединяются в общую матрицу для всего эксперимента и повторно анализируются после нормализации.
Перед отправкой образцов на секвенирование настоятельно рекомендуем ознакомиться с требованиями — это обеспечит наилучшие результаты. Наша команда готова оказать поддержку и консультации на каждом этапе подготовки.
Оставьте свои контактные данные и наши менеджеры свяжутся с вами в ближайшее время!