TruSight Oncology 500 (TSO 500)
Каждая опухоль уникальна. Поэтому для правильного лечения необходимо знать и понимать молекулярную патологию опухоли. С помощью комплексного геномного профилирования (CTP) можно одновременно анализировать сотни генов и биомаркеров, связанных с раком. Шансы на обнаружение значимых изменений увеличиваются за счет одновременной оценки всех этих генов и биомаркеров. Этот подход позволяет получать результаты быстрее и экономить материал биопсийных образцов. Один из способов комплексного профилирования опухоли – это тест TruSight™ Oncology 500 Assay. С помощью этого теста анализируются 523 гена, связанных с раком, на наличие однонуклеотидных вариантов (SNVs), вставок и делеций (indels) и вариаций числа копий (CNVs). Кроме того, оцениваются опухолевая мутационная нагрузка (TMB) и микросателлитная нестабильность (MSI). TMB измеряет количество соматических мутаций в опухоли пациента с раком и выражается в мутациях на мегабазу (mut/Mb). MSI указывает на сбои в системе репарации ДНК.
Новейшее качественное оборудование
Изучите наш портфель услуг для TSO500
Мы предлагаем различные продукты TSO500 для решения разнообразных исследовательских задач. К каждому нашему исследованию могут быть добавлены дополнительные услуги. Будем рады проконсультировать вас.

TSO500

TSO500 ctDNA

Виды

Человек

Виды

Человек

Панель секвенирования

TruSight™ Oncology 500

Панель секвенирования

TruSight™ Oncology 500 ctDNA

Количество генов

523

Количество генов

523

Стартовый материал

Свежая замороженная ткань, FFPE, высокомолекулярная ДНК или фрагментированная ДНК

Стартовый материал

Цельная кровь (например, Streck® tubes), плазма, другие биологические жидкости, изолированные нуклеиновые кислоты

Платформа секвенирования

Illumina

Платформа секвенирования

Illumina

Результаты

Отчет о проекте и отчет о TMB и MSI, файлы: FASTQ, BAM, VCF, TSV

Результаты

Отчет о проекте и отчет о TMB и MSI, файлы: FASTQ, BAM, VCF, TSV

93 500 рублей

185 650 рублей

TSO500

Виды

Человек

Панель секвенирования

TruSight™ Oncology 500

Количество генов

523

Стартовый материал

Свежая замороженная ткань, FFPE, высокомолекулярная ДНК или фрагментированная ДНК

Платформа секвенирования

Illumina

Результаты

Отчет о проекте и отчет о TMB и MSI, файлы: FASTQ, BAM, VCF, TSV

93 500 рублей

TSO500 ctDNA

Виды

Человек

Панель секвенирования

TruSight™ Oncology 500 ctDNA

Количество генов

523

Стартовый материал

Цельная кровь (например, Streck® tubes), плазма, другие биологические жидкости, изолированные нуклеиновые кислоты

Платформа секвенирования

Illumina

Результаты

Отчет о проекте и отчет о TMB и MSI, файлы: FASTQ, BAM, VCF, TSV

185 650 рублей

Оборудование
Исследования проводятся с использованием системы NovaSeq 6000 и NovaSeq X Plus — это быстрые и самые точные системы секвенирования коротких прочтений.

Образцы WGS секвенируются в режиме 2 x 100 bp или 2 x 150 bp, в зависимости от объекта и требований заказчика.

Если вам необходимы параметры секвенирования, отличающиеся от тех, что представлены выше, сообщите, пожалуйста! Мы можем предложить дополнительные варианты решений.
Результаты исследования
В доставку включены демультиплексированные
и триммированные файлы формата FASTQ. Дополнительные биоинформатические опции также доступны
Размещение данных 
на защищенном сервере
Удаленный носитель
Доставка данных 
на жестком диске
Физический носитель
Биоинформатика
Сырые данные секвенирования (формат FASTQ) автоматически обрабатываются с использованием софта TSO500 (Illumina). Анализ включает выравнивание данных секвенирования (формат BAM), выявление и аннотацию однонуклеотидных вариантов (SNVs), вставок и делеций (indels), а также ДНК-фьюжнов (форматы VCF, TSV и JSON). Кроме того, оцениваются вариации числа копий (CNVs) (формат VCF) и статус TMB/MSI (формат TSV). В дополнение к данным создается отчет по проекту (формат PDF).
Требования к образцам
Перед отправкой образцов на секвенирование, крайне рекомендуем внимательно ознакомиться с требованиями к образцам, чтобы обеспечить наилучшие результаты.

На нашем сайте вы найдете подробную информацию о необходимых объемах и качестве образцов, а также хранению и транспортировке.

Мы понимаем, что подготовка образцов может вызывать вопросы, поэтому наша команда готова оказать вам поддержку и консультации на каждом этапе процесса. Не стесняйтесь обращаться к нам – ваше удобство и успешное проведение исследования для нас приоритетны.
Закажите исследование
Оставьте свои контактные данные и наши менеджеры свяжутся с Вами в ближайшее время!