Анализ метилома

Анализ метилирования ДНК

Метилирование ДНК является одной из самых распространенных эпигенетических модификаций, которая существенно влияет на экспрессию генов, клеточную дифференцировку и геномный импринтинг. Без изменения самой последовательности ДНК активность и функция генов могут регулироваться метилированием ДНК. Метилтрансферазы ДНК осуществляют регуляцию активности и функции генов, перенося метильную группу на пятый углерод цитозинового кольца. У млекопитающих образующиеся 5-метилцитозины (5-mC) и 5-гидроксиметилцитозины (5-hmC) встречаются главным образом в динуклеотидах цитозин-фосфат-гуанин (CpG). Однако метилирование может также происходить в некодирующих CpG контекстах у других организмов.

Изменения в эпигенетических сигнатурах, особенно в метилировании ДНК, были отмечены в нормальном развитии клеток и старении. Однако изменения в метилировании ДНК также тесно связаны с такими заболеваниями, как рак, метаболические расстройства и неврологические заболевания. Глобальная гипометилирование и локус-специфическая гиперметилирование CpG-островков показаны как увеличивающие геномную нестабильность и способствующие прогрессированию опухолей.

Новейшее качественное оборудование

Техническая информация

Мы предлагаем детекцию метилирования по всему геному, включая области с низкой плотностью цитозин-фосфат-гуанин (CpG). Во время генерации библиотеки неметилированные цитозины преобразуются в урацилы, и поэтому могут быть выделены из метилированных и гидроксиметилированных цитозинов. Для преобразования мы используем ферментативный метод (ферментативное Methyl-Seq, EM-seq™). По сравнению с традиционным бисульфитным преобразованием, которое обычно применяется для секвенирования всего генома (WGBS), более щадящее ферментативное преобразование вызывает значительно меньше повреждений ДНК, что приводит к более точному определению метилирования. Для получения дополнительной информации, пожалуйста, ознакомьтесь с нашей технической заметкой.
Предлагается секвенирование (2 x 100 п.н.) с использованием платформы Illumina. Если вам требуются другие параметры секвенирования, пожалуйста, сообщите нам! Мы можем предложить дополнительные решения.

Оборудование

Исследования проводятся с использованием системы NovaSeq 6000 и NovaSeq X Plus — это быстрые и самые точные системы секвенирования коротких прочтений.

Образцы WGS секвенируются в режиме 2 x 100 bp или 2 x 150 bp, в зависимости от объекта и требований заказчика.

Если вам необходимы параметры секвенирования, отличающиеся от тех, что представлены выше, сообщите, пожалуйста! Мы можем предложить дополнительные варианты решений.

Требования к образцам

Перед отправкой образцов на секвенирование, крайне рекомендуем внимательно ознакомиться с требованиями к образцам, чтобы обеспечить наилучшие результаты.

На нашем сайте вы найдете подробную информацию о необходимых объемах и качестве образцов, а также хранению и транспортировке.

Мы понимаем, что подготовка образцов может вызывать вопросы, поэтому наша команда готова оказать вам поддержку и консультации на каждом этапе процесса. Не стесняйтесь обращаться к нам – ваше удобство и успешное проведение исследования для нас приоритетны.

Закажите исследование

Оставьте свои контактные данные и наши менеджеры свяжутся с Вами в ближайшее время!