Транскриптом включает все РНК, присутствующие в определённом типе клеток/тканей в конкретное время. Их наличие и количество соответствуют текущему метаболическому состоянию клеток и зависят от внешних и внутренних изменений. Секвенирование транскриптома — мощный метод для обнаружения и количественной оценки РНК.
Области применения и цели секвенирования транскриптома разнообразны и включают:
анализ уровня дифференциальной экспрессии генов, обнаружение альтернативного сплайсинга и ранее неизвестных транскриптов.
Мы предлагаем различные услуги секвенирования транскриптома, которые обеспечивают надёжное и точное понимание присутствующих РНК в определённом типе клеток или тканей в конкретное время.
От мРНК-специфичного скрининга на качественной РНК до кастомных проектов с рибодеплецией и прокариотами.
Исследования проводятся с использованием систем NovaSeq 6000 и NovaSeq X Plus — это быстрые и самые точные системы секвенирования коротких прочтений. Образцы секвенируются в режиме 2 × 100 bp или 2 × 150 bp, в зависимости от объекта и требований заказчика.
Если вам нужны параметры, отличные от стандартных — сообщите, мы можем предложить дополнительные варианты.
Подробнее о технологиях →В доставку включены демультиплексированные и триммированные файлы формата FASTQ. Дополнительные биоинформатические опции также доступны.
Размещение данных на защищённом сервере. Защищённая ссылка для скачивания с подтверждением целостности по контрольным суммам.
Доставка данных на жёстком диске — для больших проектов и случаев, когда внутренние политики клиента ограничивают онлайн-передачу.
Сырые данные секвенирования обрабатываются автоматически. Базовый Уровень 1 всегда включён в стоимость; более высокие уровни — дополнительная опция.
Демультиплексирование и обрезка адаптеров (FASTQ).
Выравнивание на референс (BAM).
Нормализация экспрессии (TSV).
Сравнение групп и DEG-анализ (TSV). Тепловые карты, MA-plot, volcano-plot (PDF). ⚠ Требуется минимум 3 повторности в каждой группе.
GO Анализ (TSV, PDF) — для любых организмов. KEGG-анализ (TSV, PDF) — только для человеческих образцов.
Перед отправкой образцов на секвенирование настоятельно рекомендуем ознакомиться с требованиями — это обеспечит наилучшие результаты. Наша команда готова оказать поддержку и консультации на каждом этапе подготовки.
Оставьте свои контактные данные и наши менеджеры свяжутся с вами в ближайшее время!