Области применения и цели секвенирования транскриптома разнообразны и включают:
- анализ уровня дифференциальной экспрессии генов,
- обнаружение альтернативного сплайсинга и ранее неизвестных транскриптов.
Мы предлагаем различные услуги секвенирования транскриптома, которые обеспечивают надежное и точное понимание присутствующих РНК в определенном типе клеток или тканей в конкретное время.
CTS Classic
Виды
Эукариоты
Качество РНК
RIN > 8
Целевой регион
мРНК
Платформа секвенирования
Illumina
Объем данных секвенирования
6 Гб (30М кластеров)
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
30 000 рублей
WTS Classic
Виды
Человек, мышь, крыса
Качество РНК
Различное/низкое качество
Целевой регион
тотальная РНК, с рибодеплецией
Платформа секвенирования
Illumina
Объем данных секвенирования
6 Гб (30М кластеров)
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
38 800 рублей
WTS Classic Deep
Виды
Человек, мышь, крыса
Качество РНК
Различное/низкое качество
Целевой регион
тотальная РНК, с рибодеплецией
Платформа секвенирования
Illumina
Объем данных секвенирования
10Гб (50М кластеров)
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
41 700 рублей
TS Flex
Виды
Эукариоты, прокариоты
Качество РНК
Различное/низкое качество
Целевой регион
мРНК, тотальная РНК (с/без рибодеплеции)
Платформа секвенирования
Illumina
Объем данных секвенирования
В соответсвии с требованиями заказчика
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
Рассчитывается в соответствии с требованиями
CTS Classic
WTS Classic
WTS Classic Deep
TS Flex
Виды
Эукариоты
Виды
Человек, мышь, крыса
Виды
Человек, мышь, крыса
Виды
Эукариоты, прокариоты
Качество РНК
RIN > 8
Качество РНК
Различное/низкое качество
Качество РНК
Различное/низкое качество
Качество РНК
В зависимости от протокола
Целевой регион
мРНК
Целевой регион
тотальная РНК, с рибодеплецией
Целевой регион
тотальная РНК, с рибодеплецией
Целевой регион
тотальная РНК (с/без рибодеплеции)
Платформа секвенирования
Illumina
Платформа секвенирования
Illumina
Платформа секвенирования
Illumina
Платформа секвенирования
Illumina
Объем данных секвенирования
6 Гб (30М кластеров)
Объем данных секвенирования
6 Гб (30М кластеров)
Объем данных секвенирования
10Гб (50М кластеров)
Объем данных секвенирования
В соответсвии с требованиями заказчика
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
30 000 рублей
38 800 рублей
41 700 рублей
Рассчитывается в соответствии с требованиями
Образцы WGS секвенируются в режиме 2 x 100 bp или 2 x 150 bp, в зависимости от объекта и требований заказчика.
Если вам необходимы параметры секвенирования, отличающиеся от тех, что представлены выше, сообщите, пожалуйста! Мы можем предложить дополнительные варианты решений.
и триммированные файлы формата FASTQ. Дополнительные биоинформатические опции также доступны
Все более высокие уровни обработки включают данные с более низких уровней. Независимо от уровня анализа, в дополнение к данным, создается технический отчет.
Уровень 1:
- Демультиплексирование и обрезка адаптеров (формат FASTQ)
- Выравнивание (формат BAM)
- Нормализация (формат TSV)
- Сравнение групп и анализ дифференциальной экспрессии генов (формат TSV)
- Визуализация в виде тепловой карты, MA-plot и volcano-plot (формат PDF)
Уровень 5 (одно из следующих или оба):
- GO Анализ (в форматах TSV и PDF) - для любых организмов
- KEGG-анализ (в форматах TSV и PDF) - только для человеческих образцов
На нашем сайте вы найдете подробную информацию о необходимых объемах и качестве образцов, а также хранению и транспортировке.
Мы понимаем, что подготовка образцов может вызывать вопросы, поэтому наша команда готова оказать вам поддержку и консультации на каждом этапе процесса. Не стесняйтесь обращаться к нам – ваше удобство и успешное проведение исследования для нас приоритетны.