Связаться
Оставьте свои контакты. Мы с вами свяжемся и обсудим вашу задачу
Нажимая на кнопку, вы соглашаетесь с нашей политикой обработки персональных данных
Секвенирование генома
Получите самую полную генетическую информацию об объекте исследования
Геном представляет собой полный набор генетической информации организма. Сравнивая генетические данные объекта исследования с референсным геномом, можно изучать однонуклеотидные варианты (SNVs), малые вставки и делеции (Indels), вариации числа копий (CNVs) и структурные варианты (SVs).
Исследования полного генома вносят вклад в:
Исследования полного генома вносят вклад в:
- изучение рака, подходы персонализированной медицины и трансляционные исследования;
- открытие биомаркеров и понимание фармакогенетики;
- исследование заболеваний;
- агрогенетику;
- изучение микроорганизмов.
Оборудование Illumina и PacBio
Изучите наш портфель продуктов для секвенирования генома
Мы предоставляем комплексную и первоклассную поддержку проекта – от выбора подходящего продукта до оценки данных.
WGS Large Classic
WGS Small Classic
WGS Flex
HiFi WGS
Виды
Человек, Мышь/Крыса
Виды
Микроорганизмы
(размер генома менее 20 Мб)
Микроорганизмы
(размер генома менее 20 Мб)
Виды
Различные
Различные
Виды
Различные
Различные
Качество ДНК
Высокомолекулярная ДНК
Качество ДНК
Высокомолекулярная ДНК
Высокомолекулярная ДНК
Качество ДНК
Различное качество ДНК
(например, фрагментированная)
Различное качество ДНК
(например, фрагментированная)
Качество ДНК
Высокомолекулярная ДНК
Высокомолекулярная ДНК
Протокол
+/- ПЦР амплификация
Протокол
С ПЦР амплификацией
С ПЦР амплификацией
Протокол
+/- ПЦР амплификация
+/- ПЦР амплификация
Протокол
Без ПЦР амплификации
Без ПЦР амплификации
Длина прочтений
2 x 150 bp
Длина прочтений
2 x 150 или 2 x 100 bp
2 x 150 или 2 x 100 bp
Длина прочтений
2 x 150 или 2 x 100 bp
2 x 150 или 2 x 100 bp
Длина прочтений
До 18 кб
До 18 кб
Платформа секвенирования
Illumina
Платформа секвенирования
Illumina
Illumina
Платформа секвенирования
Illumina
Illumina
Платформа секвенирования
PacBio
PacBio
Объем данных секвенирования
90 Гбаз
(~30X для генома человека)
Объем данных секвенирования
2 Гбазы
2 Гбазы
Объем данных секвенирования
В соответсвии с требованиями заказчика
В соответсвии с требованиями заказчика
Объем данных секвенирования
В соответсвии с требованиями заказчика
В соответсвии с требованиями заказчика
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
Отчёт и файлы FASTQ
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
Отчёт и файлы FASTQ
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
Отчёт и файлы FASTQ
64 700 руб.
15 500 руб.
Рассчитывается в соответсвии с требованиями
Рассчитывается в соответствии с требованиями
WGS Large Classic
Виды
Человек, Мышь/Крыса
Качество ДНК
Высокомолекулярная ДНК
Протокол
+/- ПЦР амплификация
Длина прочтений
2 x 150 bp
Платформа секвенирования
Illumina
Объем данных секвенирования
90 Гб
(~30X для генома человека)
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
64 700 руб
WGS Small Classic
Виды
Микроорганизмы
(размер генома менее 20 Мб)
Качество ДНК
Высокомолекулярная ДНК
Протокол
+ПЦР амплификация
Длина прочтений
2 x 150 или 2 x 100 bp
Платформа секвенирования
Illumina
Объем данных секвенирования
2 Гб
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
15 500 руб
WGS Flex
Виды
Различные
Качество ДНК
Различное качество ДНК
(например, фрагментированная)
Протокол
+/- ПЦР амплификация
Длина прочтений
2 x 150 или 2 x 100 bp
Платформа секвенирования
Illumina
Объем данных секвенирования
В соответсвии с требованиями заказчика
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
Рассчитывается в соответсвии с требованиями
HiFi WGS
Виды
Эукариоты, Прокариоты
Качество ДНК
Высокомолекулярная ДНК
Протокол
- ПЦР амплификация
Длина прочтений
До 18 кб
Платформа секвенирования
PacBio
Объем данных секвенирования
В соответсвии с требованиями заказчика
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
Рассчитывается в соответсвии с требованиями
Оборудование
Исследования проводятся с использованием системы NovaSeq 6000 и NovaSeq X Plus — это быстрые и самые точные системы секвенирования коротких прочтений.
Образцы WGS секвенируются в режиме 2 x 100 bp или 2 x 150 bp, в зависимости от объекта и требований заказчика.
Если вам необходимы параметры секвенирования, отличающиеся от тех, что представлены выше, сообщите, пожалуйста! Мы можем предложить дополнительные варианты решений.
Образцы WGS секвенируются в режиме 2 x 100 bp или 2 x 150 bp, в зависимости от объекта и требований заказчика.
Если вам необходимы параметры секвенирования, отличающиеся от тех, что представлены выше, сообщите, пожалуйста! Мы можем предложить дополнительные варианты решений.
Удаленный носитель
Размещение данных
на защищенном сервере
Физический носитель
Доставка данных
на жестком диске
Результаты исследования
По умолчанию, в доставку включены демультиплексированные
и триммированные файлы формата FASTQ. Дополнительные биоинформатические опции также доступны
и триммированные файлы формата FASTQ. Дополнительные биоинформатические опции также доступны
Биоинформатика
Сырые данные секвенирования автоматически обрабатываются. Мы предлагаем разные уровни биоинформатического анализа. Базовый уровень - это Уровень 1 и он всегда включен в стоимость.
Все более высокие уровни обработки включают данные с более низких уровней. Независимо от уровня анализа, в дополнение к данным, создается технический отчет.
Все более высокие уровни обработки включают данные с более низких уровней. Независимо от уровня анализа, в дополнение к данным, создается технический отчет.
Анализ образцов ДНК с использованием платформы Illumina для:
Для образцов человеческой ДНК мы можем проводить анализы, основанные на человеческих референсах hg19 или GRCh38.
Уровень 1:
Уровень 2:
Уровень 3:
выявление однонуклеотидных вариантов (SNVs) и малых вставок и делеций (InDels) (формат VCF);
выявление регионов гомозиготности (ROH) (форматы BED и CSV) (только для образцов человека);
метрики (формат CSV).
Уровень 4:
Уровень 5:
- WGS Large Classic
- WGS Small Classic
- WGS Flex
- WGS Large Classic и WGS Flex анализируются с использованием платформы Illumina DRAGEN Bio-IT. WGS Small Classic анализируется с использованием пайплайна CeGaT.
Для образцов человеческой ДНК мы можем проводить анализы, основанные на человеческих референсах hg19 или GRCh38.
Уровень 1:
- демультиплексирование и обрезка адаптеров (формат FASTQ);
- метрики (формат CSV);
- отчет MultiQC (формат HTML).
Уровень 2:
- картирование (формат BAM);
- предсказание плоидности половых хромосом (файл CSV) (только для образцов человека);
- метрики (формат CSV).
Уровень 3:
выявление однонуклеотидных вариантов (SNVs) и малых вставок и делеций (InDels) (формат VCF);
выявление регионов гомозиготности (ROH) (форматы BED и CSV) (только для образцов человека);
метрики (формат CSV).
Уровень 4:
- аннотация SNVs и инделов (форматы JSON и TSV) (только для образцов человека).
Уровень 5:
- выявление вариаций числа копий (CNVs) (форматы VCF и GFF3) включая аннотации (форматы JSON и TSV) (аннотации только для образцов человека);
- обнаружение структурных вариантов (SVs), таких как транслокации, инверсии, а также крупные и средние инделы (форматы VCF и CSV) включая аннотации (форматы JSON и TSV) (аннотации только для образцов человека);
- метрики (формат CSV).
Анализ образцов ДНК с использованием платформы PacBio для:
Наш продукт HiFi WGS анализируется с использованием платформы PacBio.
Уровень 1:
Уровень 2:
Уровень 3:
- HiFi WGS
Наш продукт HiFi WGS анализируется с использованием платформы PacBio.
Уровень 1:
- демультиплексирование и клиппирование секвенированных данных (формат обрезанного BAM).
Уровень 2:
- обрезанные данные секвенирования в формате FASTQ.
Уровень 3:
- мэппинг секвенированных данных (форматы BAM и PBI).
Биоинформатика
Сырые данные секвенирования автоматически обрабатываются. Мы предлагаем разные уровни биоинформатического анализа. Базовый уровень - это Уровень 1 - он всегда включен в стоимость.
Все более высокие уровни обработки включают данные с более низких уровней. Независимо от уровня анализа, в дополнение к данным, создается технический отчет.
Все более высокие уровни обработки включают данные с более низких уровней. Независимо от уровня анализа, в дополнение к данным, создается технический отчет.
Анализ образцов ДНК с использованием платформы Illumina для:
Для образцов человеческой ДНК мы можем проводить анализы, основанные на человеческих референсах hg19 или GRCh38.
Уровень 1:
Уровень 2:
Уровень 3:
выявление однонуклеотидных вариантов (SNVs) и малых вставок и делеций (инделов) (формат VCF);
выявление регионов гомозиготности (ROH) (форматы BED и CSV) (только для образцов человека);
метрики (формат CSV).
Уровень 4:
Уровень 5:
- WGS Large Classic
- WGS Small Classic
- WGS Flex
- WGS Large Classic и WGS Flex анализируются с использованием платформы Illumina DRAGEN Bio-IT. WGS Small Classic анализируется с использованием пайплайна CeGaT.
Для образцов человеческой ДНК мы можем проводить анализы, основанные на человеческих референсах hg19 или GRCh38.
Уровень 1:
- демультиплексирование и обрезка адаптеров секвенируемых данных (формат FASTQ);
- метрики (формат CSV);
- отчет MultiQC (формат HTML).
Уровень 2:
- картирование (формат BAM);
- предсказание плоидности половых хромосом (файл CSV) (только для образцов человека);
- метрики (формат CSV).
Уровень 3:
выявление однонуклеотидных вариантов (SNVs) и малых вставок и делеций (инделов) (формат VCF);
выявление регионов гомозиготности (ROH) (форматы BED и CSV) (только для образцов человека);
метрики (формат CSV).
Уровень 4:
- аннотация SNVs и инделов (форматы JSON и TSV) (только для образцов человека).
Уровень 5:
- выявление вариаций числа копий (CNVs) (форматы VCF и GFF3) включая аннотации (форматы JSON и TSV) (аннотации только для образцов человека);
- обнаружение структурных вариантов (SVs), таких как транслокации, инверсии, а также крупные и средние инделы (форматы VCF и CSV) включая аннотации (форматы JSON и TSV) (аннотации только для образцов человека);
- метрики (формат CSV).
Анализ образцов ДНК с использованием платформы PacBio для:
Наш продукт HiFi WGS анализируется с использованием платформы PacBio.
Уровень 1:
Уровень 2:
Уровень 3:
- HiFi WGS
Наш продукт HiFi WGS анализируется с использованием платформы PacBio.
Уровень 1:
- демультиплексирование и клиппирование секвенированных данных (формат обрезанного BAM).
Уровень 2:
- обрезанные данные секвенирования в формате FASTQ.
Уровень 3:
- мэппинг секвенированных данных (форматы BAM и PBI).
Требования к образцам
Перед отправкой образцов на секвенирование, крайне рекомендуем внимательно ознакомиться с требованиями к образцам, чтобы обеспечить наилучшие результаты.
На нашем сайте вы найдете подробную информацию о необходимых объемах и качестве образцов, а также хранению и транспортировке.
Мы понимаем, что подготовка образцов может вызывать вопросы, поэтому наша команда готова оказать вам поддержку и консультации на каждом этапе процесса. Не стесняйтесь обращаться к нам – ваше удобство и успешное проведение исследования для нас приоритетны.
На нашем сайте вы найдете подробную информацию о необходимых объемах и качестве образцов, а также хранению и транспортировке.
Мы понимаем, что подготовка образцов может вызывать вопросы, поэтому наша команда готова оказать вам поддержку и консультации на каждом этапе процесса. Не стесняйтесь обращаться к нам – ваше удобство и успешное проведение исследования для нас приоритетны.
Закажите исследование
Оставьте свои контактные данные и наши менеджеры свяжутся с Вами в ближайшее время!