Связаться
Оставьте свои контакты. Мы с вами свяжемся и обсудим вашу задачу
Нажимая на кнопку, вы соглашаетесь с нашей политикой обработки персональных данных
Секвенирование полноразмерного гена 16S рРНК
Секвенирование гена 16S рРНК
Ген 16S рибосомной РНК (rRNA) имеет длину около 1,5 кб и содержит несколько консервативных и гипервариабельных регионов (V1-V9), которые различаются у разных бактерий. Эти гипервариабельные последовательности могут быть использованы для идентификации и характеристики микробного разнообразия. Поэтому ген 16S rRNA является общим маркером для характеристики микробных сообществ в различных образцах.
Используя технологию PacBio для секвенирования в реальном времени (SMRT), мы точно секвенируем полный ген 16S rRNA, охватывая все вариабельные регионы со средней длиной чтений HiFi около 1,5 кб. Исключительная точность и длина чтений HiFi PacBio, полученных с использованием режима циклического консенсусного секвенирования (CCS), позволяют детектировать микробные таксоны с высокой разрешающей способностью.
Используя технологию PacBio для секвенирования в реальном времени (SMRT), мы точно секвенируем полный ген 16S rRNA, охватывая все вариабельные регионы со средней длиной чтений HiFi около 1,5 кб. Исключительная точность и длина чтений HiFi PacBio, полученных с использованием режима циклического консенсусного секвенирования (CCS), позволяют детектировать микробные таксоны с высокой разрешающей способностью.
Технология PacBio
Изучите наш портфель продуктов для секвенирования 16S рРНК
Мы предлагаем полное секвенирование гена 16S для решения различных исследовательских вопросов. Хотите, чтобы на ваших данных были проведены дополнительные биоинформатические анализы, помимо включенных в поставку? Наш продукт может быть дополнен дополнительными услугами. Мы будем рады проконсультировать вас.
Full-Length 16S Sequencing
Виды
Бактерии
Тип образца
Метагеномная ДНК
Цель
Полный ген 16S рРНК (области V1-V9)
Длина чтения
Приблизительно 1.5 кб
Платформа секвенирования
PacBio
Объем данных секвенирования
15 000 HiFi-чтений на образец
Результаты
Отчёт и файлы FASTQ
60 – 119 образцов - 8 500 рублей*
≥120 образцов - 6 500 рублей*
*цена за 1 образец, минимальный размер партии 60 образцов
Оборудование
Исследования проводятся с использованием системы NovaSeq 6000 и NovaSeq X Plus — это быстрые и самые точные системы секвенирования коротких прочтений.
Образцы WGS секвенируются в режиме 2 x 100 bp или 2 x 150 bp, в зависимости от объекта и требований заказчика.
Если вам необходимы параметры секвенирования, отличающиеся от тех, что представлены выше, сообщите, пожалуйста! Мы можем предложить дополнительные варианты решений.
Образцы WGS секвенируются в режиме 2 x 100 bp или 2 x 150 bp, в зависимости от объекта и требований заказчика.
Если вам необходимы параметры секвенирования, отличающиеся от тех, что представлены выше, сообщите, пожалуйста! Мы можем предложить дополнительные варианты решений.
Результаты исследования
В доставку включены демультиплексированные
и триммированные файлы формата FASTQ. Дополнительные биоинформатические опции также доступны
и триммированные файлы формата FASTQ. Дополнительные биоинформатические опции также доступны
Размещение данных
на защищенном сервере
Удаленный носитель
Доставка данных
на жестком диске
Физический носитель
Биоинформатика
Сырые данные секвенирования обрабатываются автоматически. Мы предлагаем различные уровни биоинформатического анализа. Уровень по умолчанию — Уровень 1. С увеличением уровня биоинформатического анализа предоставляется больше данных. Более высокий уровень включает данные с нижнего уровня. В дополнение к данным, независимо от уровня анализа, создается отчет по проекту.
Уровень 1:
Уровень 2:
- Демультиплексирование секвенированных данных (HiFi чтения, формат FASTQ)
Уровень 2:
- Таксономическая классификация до уровня видов (по возможности)
- Сопоставление секвенированных данных с базой данных микробиома (формат FASTA, RMA)
- Создание таксономических таблиц, включая количество последовательностей и относительное изобилие (форматы XLSX, TSV и BIOM)
- Создание столбчатых диаграмм, показывающих относительное изобилие (формат PNG)
Требования к образцам
Перед отправкой образцов на секвенирование, крайне рекомендуем внимательно ознакомиться с требованиями к образцам, чтобы обеспечить наилучшие результаты.
На нашем сайте вы найдете подробную информацию о необходимых объемах и качестве образцов, а также хранению и транспортировке.
Мы понимаем, что подготовка образцов может вызывать вопросы, поэтому наша команда готова оказать вам поддержку и консультации на каждом этапе процесса. Не стесняйтесь обращаться к нам – ваше удобство и успешное проведение исследования для нас приоритетны.
На нашем сайте вы найдете подробную информацию о необходимых объемах и качестве образцов, а также хранению и транспортировке.
Мы понимаем, что подготовка образцов может вызывать вопросы, поэтому наша команда готова оказать вам поддержку и консультации на каждом этапе процесса. Не стесняйтесь обращаться к нам – ваше удобство и успешное проведение исследования для нас приоритетны.
Закажите исследование
Оставьте свои контактные данные и наши менеджеры свяжутся с Вами в ближайшее время!